Como Tony está no espaço em um missão secreta há várias semanas, Jeannie precisa trazer Tony de volta ou encontrar um amo temporário, ou terá que voltar definitivamente ao plano mágico. Nenhuma das duas tarefas será fácil pois ela terá que enfrentar o General da base, dois ladrões e sua irmã Jeannie II, que está disposta a tudo para atrapalhar os planos de Jeannie. A ajuda vem do velho amigo Roger Healey e de Simpson, professor de seu filho.
